מסננים

המסננים הינם לב ליבו של החדר הנקי מאחר והם אלו שיכתיבו בסופו של דבר את רמת הניקיון בחדר בהתקיים כל הפרמטרים הנוספים. כל מסנן המותקן בתיקרת החדר מיועד לסנן את אספקת האויר הנכנס לחדר הנקי. האויר היוצא מהתיקה  (בין אם דרך מסנן תקרתי רגיל או יחידת (FFU (FAN FILTER UNIT חייב להיבק מייד עם התקנתו על מנת לוודא כי עומד ברמת הסינון הנדרשת. מסנן פגום משמעו זיהום באזור בו הוא ממוקם, דבר היכול לפגיעבה ברמת הסינון הנדרשת שעלולה להביא לפגיעה במוצר. המסננים המותקנים בחדר הנקי הינם מסננים אבסולוטיים מסוג HEPA או ULPA. רמת הסינון למסנן HEPA הינה 99.99% לחלקיקים בגודל 0.3 מיקרון ומעלה בעוד שמסנן ULPA המחמיר יותר מסנן 99.999% לחלקיקים בגודל 0.12 מיקרון.

במקרים בהם משולבות יחידות FFU תקרתיות הייחדה עצמה כוללת מסנן אבסולוטי עם יחידת מפוח פנימית. המפוח דוחף את האויר הנקי מהפלנום (חלל הנוצר בין תיקרת החדר הנקי המונמכת לתיקרת הבנין) אל תוך החדר הנקי. גם ביחידות ה FFU ישנן יחידות המצוידות במסנן HEPA וכאלו המצוידות במסנן ULPA. הההחלטה לגבי סוג המסנן ביחדת ה FFU נקבעת עפ"י הדרישה לרמות ניקיון מחמירות יותר או פחות.